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현이의 데일리 공부

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signal transduction과 propagation의 General principles 그리고 T cell receptor(TCR)의 signaling 및 Co-stimulatory and inhibitory receptor 1. Enzyme Associated Receptors - Receptor 자체에 kinase domain이 있는 경우, ligand가 receptor에 binding하면, receptor가 phosphorylation되면서 다음 신호의 활성을 유도하게 됩니다. - Receptor 내에 kinase domain을 가지고 있지 않은 경우, kinase domain을 가진 molecule이 receptor에 붙고, ligand가 receptor에 binding하게 되면, kinase domain을 가진 molecule이 phosphorylation되면서 신호가 활성화됩니다. 2. Multiprotein Signaling Complexes intracellular signaling은 multiprotein s..
Human MHC과 'Polymorphism, Polygeny, Gene conversion' 그리고 MHC restriction의 정의와 예외 Human MHC=HLA(human leukocyte antigen) - Class l: HLA-A, HLA-B, HLA-C - Class ll: HLA-DR, HLA-DP ,HLA-DQ Class l의 HLA-A,B,C는 heavy chain 1개씩으로 이루어져 있지만, Class ll의 DR, DP, DQ는 α, β chain이 결합한 형태입니다. HLA-DM과 HLA-DO도 Class ll region에 함께 존재합니다. Class l molecule의 antigen transporter 역할을 한다고 배웠던 TAP molecule과 Proteasome의 역할을 하는 LMP molecule도 Class ll region에 위치합니다. Class l과 Class ll region 사이에는 antige..
Antigen recognition by T cell, MHC Class l molecule antigen presenting, MHC class ll molecule Antigen Presenting T cell의 항원 인식 부분은 peptide:MHC complex와 접속하여 인식합니다. 인식 부위에는 CDR1, CDR2, CDR3 region이 있는데 α, β chain의 CDR3 region이 항원을 인식하는데 가장 중요합니다. T cell receptor(TCR)의 ligand는 peptide: MHC molecule입니다. CD4 T cell은 MHC class ll와 결합하고 CD8 T cell은 MHC class l과 결합합니다. CD4와 CD8 molecule은 MHC molecule과 결합함으로써 MHC molecule과 TCR의 결합을 더 강화하는 역할을 합니다. 따라서 이들 CD4와 CD8 molecule을 co-receptor라고 합니다. 항원 제공에서 중요한 건 “T cell은..
서로 다른 immunoglobulin isotype의 구조적 특징(lgM, lgD, lgG, lgA, lgE)과 C region의 기능 그리고 항체의 transmembrane form과 secreted form의 regulation (줄글 주의) 1. TCR의 C region은 V region의 structural support 역할을 합니다. TCR은 항상 membrane bound form으로 존재하기 때문에 TCR을 membrane에 고정하는 역할을 합니다. 또한 TCR의 C region은 생성된 후 전혀 변화하지 않습니다. 2. immunoglobulin은 transmembrane 형태와 secreted antibody 형태 모두 만들어집니다. 그리고 rearrangement가 끝난 후에도 class swithching이 일어날 수 있습니다. 3. Antibody의 class는 어떤 heavy chain의 C region이 사용되는지에 따라 결정됩니다. 어떤 C region을 사용할지 결정하는 두 개의 주요한 메커니즘에는 a..
Gene rearrangement의 정의와 Somatic rearrangement 및 V, D, J gene segment의 과정 및 RAG-1, RAG-2의 반응 그리고 Ubiquitous Proteins와 Junctional diversity lmmuoglobulin과 TCR의 다양성을 결정하는 데 가장 중요한 기작으로 이는 크게 3군데에 일어납니다. 1> 항체의 Heavy chain과 Light chain의 Variable regions 2> TCR의 Va, VB region 3> CDR (항체와 TCR의 antigen binding site를 결정한다.) 인간 genome에는 30억 개의 nucleotide가 존재하고 5만개의 유전자를 coding할 수 있지만, 이 것만으로는 antigen receptor의 충분한 diversity를 형성할 수 없는데요!! 이를 해결하기 위해 Variable region은 초기에 gene segment 형태로 존재하고, lymphocyte가 성장하면서 somatic DNA recombination에 의해 ..
TCR(T세포 수용체)의 특징과 Fab fragment과의 공통점과 차이점, 그리고 MHC class l과 MHC class ll molecule(CD8, CD4) 오늘 이 글에서 기록할 내용은 제목에서 나와 있다시피 다음과 같습니다. ''TCR의 특징", "TCR과 Fab fragment의 공통점과 차이점", "MHC class l, MHC class 2의 특징과 발현 및 구조적 형태" 1. TCR(T세포 수용체) - 항상 membrane bound 형태로 존재합니다. - T cell에 intracellular signaling을 전달해서 활성화시키는 역할을 합니다. - 주조직적합항원(MHC)에 얹혀진 짧은 peptide fragment를 인식합니다. - MHC molecule은 host cell의 표면에 있는 것으로 세포 내부에서 만들어져 내부 항원을 인지하는 역할을 합니다. 2. TCR과 Fab fragment의 공통점과 차이점 1> 공통점 - TCR a:B ..
'Antibody의 구조와 Avidity/Affinity' 그리고 Protease 'Papain, Pepsin'과 항원 항체 결합 및 Epitope antibody의 구조는 variable region과 constant region으로 나눌 수 있습니다! 우선, Variable region(Vh,VI)은 다양한 sequence를 가지는 영역이고 antigen을 인식하고 recognition을 담당합니다. 그리고 Constant region(Ch,CI)은 모든 항체들이 기본 구조는 공유하며 structural component, effector function을 수행하는데 필요한 역할을 합니다. 이는 5개의 main form을 가지는데 각각의 form을 class 또는 isotype이라고 부르며 Class에는 lgM, lgD, lgG, lgA, lgE가 있습니다. 또한 항체에 존재하는 isotCype은 heavy chain의 종류가 전부 다른데, “l..
Cytokine/receptor의 특징과 종류 그리고 Adhesion Molecules 'Selectin, integrin, lg family' 작용 및 NK cell regulation 데일리 TIL 현이 1. Autocrine 자신이 분비한 cytokine을 자신이 받아들이는 방식으로, Positive regulation을 유발하여 반응을 amplification합니다. 2. Signaling across gap junction Cell간의 직접적인 channel(gap junction)을 통해 cytokine을 전달합니다. 3. Paracrine 주변의 타겟 세포에 직접 cytokine을 전달합니다. 4. Endocrine bloodstream을 통해 멀리 있는 장기까지 cytokine을 전달합니다. 1> Homodimeric receptor: 동일한 단백질 두 개로 구성됩니다. 2> Heterodimeric receptor: 서로 다른 단백질 두 개로 구성됩니다. 3> TNF fa..
Toll-like receptors (TLRs) and NOD-like receptors (NLRs) Toll-like receptors (TLRs) 1) Human TLRs - 사람이 발현하는 Toll-like receptor는 총 10가지이다. (TLR1~10) - 각 TLR은 인식하는 ligand가 다르고 TLR을 발현하는 세포의 종류도 다르다. - 기본적으로 면역세포(특히 선천면역세포)들이 많이 발현하지만, 일부 epithelial cell 등에 의해서 발현되기도 한다. TIR domain은 adaptor molecule에 의해 인식된다. (MyD88과 TRIF 두 가지가 존재) - MyD88: 대부분의 신호전달 경로에 관여 - TRIF: TLR-3, TLR-4 두 가지에만 관여 2) Different subtypes of TLR - Location: Cell surface 1> TLR-1,2: ..
Endocytosis & innate immune response/ Inflammatory response Endocytosis & innate immune response 1. Endocytosis 종류 - Phagocytosis & Macropinocytosis 외부로부터 들어오는 물질을 비특이적으로 잡아먹는 작용 - Receptor mediated Endocytosis Receptor로 특정 부분을 인식해 binding한 물질이 coating protein들에 의해서 둘러싸여져서 들어오는 계획된 형태의 endocytosis 작용 2. GPCRs (G-protein-coupled receptors) - GPCR은 PPR(Pattern recognition receptor)의 대표적인 예입니다. - fMLF(fMet-Leu-Phe) receptor: GPCP receptor family에 속하는 recept..
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